Kutup Köpekleri 3, büyülü bir sırrı çözmek için zorlu bir maceraya atılan Otto ve arkadaşlarının hikayesini konu ediyor. Yaramaz mors Otto, buzlarla kaplı Taigasville kasabasında yaşar. Bir gün yanlışlıkla gizemli bir kitabı açınca, kendisini rüyalarla dolu, fantastik bir dünyanın içerisinde bulur. Yanında zeki Jade, eğlenceli PB ve hızlı Swifty vardır. Dörtlü, karlar altındaki büyülü sırrı çözmek için zorlu bir maceraya atılır. Onların eve dönebilmesi için Otto’nun dostluğun gücüne ve kalbinin sıcaklığına inanması gerekmektedir.